После устройства альпинария необходимо постоянно поддерживать его в порядке: поливать растения, пропалывать. Некоторые разновидности растений очень быстро разрастаются, вытесняя тем самым другие виды, в связи с этим, необходимо их вовремя подстригать.

Несколько недель после посадки растений необходимо их поливать обильно. После укоренения полив потребуется только в сухую погоду. Основной уход в летний период будет состоять в прополке и рыхлении почвы в альпинарии. Также следует следить, чтобы растения не подверглись нападению вредителей или заболеваниям. Осматривать растения нужно как можно чаще, чтобы вовремя заметить проблему и решить ее.

Осенью высаживают новые луковичные растения, если есть необходимость, пересаживают некоторые растения на новое место. Кроме того, осенью альпинарий необходимо подготовить к зимовке: обрезают увядшие цветки и побеги; утепляют теплолюбивые растения; выкапывают клубни и луковицы растений, не способных к зимовке;  хвойные деревья стягивают, чтобы их ветви не сломались под тяжестью снега. Соответственным образом нужно позаботиться и о подготовке водоема, имеющегося в альпинарии. Зеркало озера накрывают соломенным матом, это нужно для того, чтобы лед не повредил его кромку. Оставшимся на зимовку рыбкам нужно обеспечить доступ кислорода.

Весной, после таяния снега альпинарий очищают от мусора, опавших листьев, снимают укрытия с растений, обновляют таблички с названиями растений, если таковые имеются. Необходимо проверить устойчивость камней, те, что расшатались, подправляют. С приходом тепла, появляются и надоевшие сорняки, с которыми вновь необходимо бороться. Весной некоторые растения нуждаются в подкормках удобрениями. После подкормок почву вокруг растений желательно мульчировать, это предупредит появление новых сорняков, а также поможет сохранить влагу в почве. Муличировать можно торфом, специальной мульчбумагой, древесными опилками, кусками коры, перепревшим навозом, смешанным с землей. Во время сильных дождей мульчированная почва не будет размываться потоками воды, устремляющимися с вершины альпийской горки к ее подножию.

Благодаря своевременному грамотному уходу, альпинарий будет радовать своих хозяев природной естественностью, буйством красок и неповторимостью в течение всего теплого сезона.